農業生物資源研究所、英国サンガー研究所とブタゲノム解読研究で合意書を締結
英国サンガー研究所とブタゲノム解読研究で合意書を締結
【要旨】
国際共同研究組織であるブタゲノムシークエンシングコンソーシアム（国際コンソーシアム）によるブタの全ゲノム塩基配列の解読を推進するため、独立行政法人農業生物資源研究所（生物研）および社団法人農林水産先端技術産業振興センター（ＳＴＡＦＦ）は、英国ウェルカムトラスト・サンガー研究所（サンガー研究所、ケンブリッジ市）と、２００６年７月２０日にブタゲノム解析に関する研究合意書を交わしました。
豚のゲノムは、人とほぼ同じく約３０億塩基対からなると推定されています。共同研究を通じて、ブタゲノム解読が進展することにより、肉質などの有用遺伝子の解明やその情報を用いた豚の育種が加速されるものと期待されます。また、豚の体は生理的、形態的に人と多くの類似点を持つことから、医学研究における貢献についても注目されています。
【研究合意の概要】
三者は、国際コンソーシアムのメンバーとして、協力してブタゲノムの解読を推進する。
生物研およびＳＴＡＦＦは、サンガー研究所が管理するブタゲノム解析用試料の提供を受け、塩基配列の解読を行う。解読結果はサンガー研究所において、全ゲノム塩基配列データの作成に供される。
共同研究の成果は、国際コンソーシアムの成果として一般に公表する。
【背景】
２００４年に鶏、牛のゲノムの概要配列が公開され、肉質、抗病性等の家畜・家きんの有用形質について、ゲノム情報を利用した育種の効率化への期待が高まっています。一方、豚においては、育種改良だけでなく、人の医学研究における実験モデルとしてもその重要性が指摘され、塩基配列の解読等によるゲノム情報の整備が望まれています。
２００３年９月より、米、英、仏を中心として、日本、韓国、中国、デンマーク等も加えた国際コンソーシアムが結成され、ゲノム解読のための材料の整備が進められてきました。さらに、２００６年１月には、米国農務省（ＵＳＤＡ）がブタゲノム解読のために１，０００万ドルを拠出することが発表され、全ゲノム解読の本格的な実施が始まっています。
ＵＳＤＡの予算によるブタゲノム解読は、世界最大のゲノム解析の拠点である英国サンガー研究所を中心に、豚のゲノム上に位置付けられたＢＡＣクローン（１）をランダムに解析する、いわゆる「階層的ショットガン」方式によって実施され、２００８年１月までに完了する予定です。２００８年初頭には、国際コンソーシアムによってブタゲノムの概要配列として公開される見通しです。
生物研は、これまでにイネゲノムの完全解読において実績を持つＳＴＡＦＦとブタゲノムの解析においても共同研究を行っており、有用遺伝子の位置を示す遺伝地図の作成、ゲノムの部分解読や体内で発現する遺伝子の解析等に注力してきましたが、今後はブタゲノム情報の一層の充実のために、全ゲノム解読において応分の国際的貢献を行うことが必要と判断しました。
【今後の展開】
生物研とＳＴＡＦＦは、ブタ全ゲノムをカバーするＢＡＣクローンの中から、担当するゲノム領域を含むＢＡＣクローンの提供をサンガー研究所より受け、解読を行います。初年度は有用遺伝子が集中する第７染色体（長腕）の解読を開始します。
解読の結果は公的データベースに登録されると共に、サンガー研究所によるブタゲノム全塩基配列データの作成に用います。得られた共同研究で得られた成果は最終的に国際コンソーシアムの成果として一般に公表されます。
生物研は、国際コンソーシアムを通じて、また国内の研究機関との間で、より一層の情報交換および共同研究を行い、ブタゲノム情報の充実とそれを利用した新たな畜産技術の開発や医学研究用のモデル動物としてのブタの新規利用への貢献を目指します。
【用語】
（１） ＢＡＣクローン
ＢＡＣ（Ｂａｃｔｅｒｉａｌ Ａｒｔｉｆｉｃｉａｌ Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ；大腸菌人工染色体）クローン巨大なゲノム全体（ブタで３０億塩基対）を断片化（１５万塩基対程度）したゲノムの一部を大腸菌に組込んで、塩基配列の分析を容易にしたもの。