富士通、国立遺伝学研究所から生命科学研究を支えるＩＴ基盤システムを受注
国立遺伝学研究所様の世界最高レベルの生命科学研究を支えるＩＴ基盤システムを受注
当社は、大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 （所在：静岡県三島市、所長：小原 雄治）様より、遺伝学・ゲノム科学・生命情報学分野における、世界最高レベルの生命科学研究を支えるＩＴ基盤システムを、一般競争入札の結果、２００６年８月３１日に受注しました。
本システムは、国立遺伝学研究所 生命情報・ＤＤＢＪ研究センターが運営し、三大国際ＤＮＡデータバンクのひとつである、日本ＤＮＡデータバンク（ＤＮＡ Ｄａｔａ Ｂａｎｋ ｏｆ Ｊａｐａｎ、以下、ＤＤＢＪ）を中心に、データベースの登録・提供サービスや、検索・解析サービスを提供するシステムです。当社のＵＮＩＸサーバ「ＰＲＩＭＥＰＯＷＥＲ（プライムパワー）」、ＰＣサーバ「ＰＲＩＭＥＲＧＹ（プライマジー）」、ストレージシステム「ＥＴＥＲＮＵＳ（エターナス）」、ＸＭＬ型データベースエンジン「Ｉｎｔｅｒｓｔａｇｅ Ｓｈｕｎｓａｋｕ Ｄａｔａ Ｍａｎａｇｅｒ（インターステージ シュンサク データ マネージャー）」をベースにしたＳｈｕｎｓａｋｕサーチャ専用機を中心に構成されます。
新システムは、２００７年３月に稼働する予定です。
【 ＩＴ基盤システム構築の経緯 】
国立遺伝学研究所 生命情報・ＤＤＢＪ研究センターは、欧州の生命情報学研究所（ＥＢＩ）、米国の国立バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）とともに、三大国際ＤＮＡデータバンクとしてＤＤＢＪを運営しています。
ＤＤＢＪは、全世界の研究者がＤＮＡの塩基配列データを登録する「国際塩基配列データベース」であり、生命情報・ＤＤＢＪ研究センターは、日本における国際的な生命科学研究の拠点として、次の５つのサービスを提供しています。
１．塩基配列データを所定のフォーマットで登録・公開する「データベース構築・提供サービス」
２．すでに登録されている塩基配列データとの類似を検索する「相同性検索サービス」
３．ＤＤＢＪのデータベースをキーワードで検索できる「キーワード検索サービス」
４．遺伝子の構造や特性を調べる「大規模解析サービス」
５．生体内における遺伝子の発現情報を蓄積する「遺伝子発現データ登録公開サービス」
ＤＤＢＪには、現在、約６，１００万件、６５０億塩基対の塩基配列データが登録されていますが、その登録件数は１９９０年代後半から加速したゲノム配列解読により年率約１．５倍という爆発的な勢いで増大しています。
また、ＤＤＢＪへのアクセスは現在１日約２万件であり、かつ、各種の検索・解析サービスといったＤＤＢＪの研究事業に対する研究所外からの利用と期待も増大の一途をたどっており、すでに現在のシステムでの対応は限界に近づいています。
さらに、既存データの検索や解析要求の多様化のために、塩基配列データベースを使用目的に合わせて加工したデータベースや、多種多様な生物系データベースの提供、これらのデータベースをもととした高度な解析機能の提供も求められています。
こうした状況を踏まえ、国立遺伝学研究所様は、塩基配列データと、それ以外の多種多様なデータの連携、検索や解析などのサービスの高速化と安定化を目的に、新システムの構成を検討されました。
一般競争入札の結果、高性能、高信頼を誇る当社のＵＮＩＸサーバ「ＰＲＩＭＥＰＯＷＥＲ」、センター運用にも対応したＰＣクラスタ（ＰＣサーバ「ＰＲＩＭＥＲＧＹ」による）、および世界最大のディスク容量と、世界最高のＩ／Ｏ処理性能を実現する当社のエンタープライズディスクアレイ「ＥＴＥＲＮＵＳ８０００」、高速な処理を実現する当社のＸＭＬ型データベースエンジン「Ｉｎｔｅｒｓｔａｇｅ Ｓｈｕｎｓａｋｕ Ｄａｔａ Ｍａｎａｇｅｒ」をベースにしたＳｈｕｎｓａｋｕサーチャ専用機を中心とする当社システムを採用されました。
【 ＩＴ基盤システムの概要 】
新システムでは、従来より提供している「データベース構築・提供サービス」、「大規模解析サービス」「相同性検索サービス」、「キーワード検索サービス」、「遺伝子発現データ登録公開サービス」などのほかに、国立遺伝学研究所様のサービスを利用されるお客様のご要望にお応えする新たなサービスとして、「国際アミノ酸配列データアノテーション公開サービス」、「文献検索サービス」が提供される予定です。
新システムは、主に以下の機器より構成されます。
・ＵＮＩＸサーバ「ＰＲＩＭＥＰＯＷＥＲ ２５００」：データベース構築・提供サービス、大規模解析サービスに使用
・ＰＣクラスタ（ＰＣサーバ「ＰＲＩＭＥＲＧＹ ＲＸ２００ Ｓ３」）：大規模解析サービスサービス、相同性検索サービスに使用
・エンタープライズディスクアレイ「ＥＴＥＲＮＵＳ８０００」：各サービスに使用
・「ＥＴＥＲＮＵＳバーチャルディスクライブラリ」：アーカイブに使用
・ネットワークサーバ「ＩＰＣＯＭ」：基幹ネットワークに使用
・ＨＰＣプログラム開発／実行環境「Ｐａｒａｌｌｅｌｎａｖｉ」：大規模解析サービスに使用
・ＸＭＬ型データベースエンジン「Ｉｎｔｅｒｓｔａｇｅ Ｓｈｕｎｓａｋｕ Ｄａｔａ Ｍａｎａｇｅｒ」をベースにしたＳｈｕｎｓａｋｕ専用機：キーワード検索サービスに使用
・バイオ分野のソフトウェア「ＢＬＡＳＴ」、「ＨＭＭＥＲ」との互換性を確保した超高速相同性検索ソリューション：相同性検索サービスに使用
【 商標について 】
記載されている製品名などの固有名詞は、各社の商標または登録商標です。
以上
［ 関連リンク ］
・ＵＮＩＸサーバ「ＰＲＩＭＥＰＯＷＥＲ」紹介サイト
http://primeserver.fujitsu.com/primepower/
・ＰＣサーバ「ＰＲＩＭＥＲＧＹ」紹介サイト
http://primeserver.fujitsu.com/primergy/
・ストレージシステム「ＥＴＥＲＮＵＳ」紹介サイト
http://storage-system.fujitsu.com/jp/
・ネットワークサーバ「ＩＰＣＯＭ」紹介サイト
http://primeserver.fujitsu.com/ipcom/
・ＨＰＣプログラム開発／実行環境「Ｐａｒａｌｌｅｌｎａｖｉ」紹介サイト
http://primeserver.fujitsu.com/primepower/hpc/pp/concept/hpc_09.html
・ＸＭＬ型データベースエンジン「Ｉｎｔｅｒｓｔａｇｅ Ｓｈｕｎｓａｋｕ Ｄａｔａ Ｍａｎａｇｅｒ」紹介サイト
http://interstage.fujitsu.com/jp/shunsaku/